钻孔取芯机钻孔时，应手感阻力不大，切削平稳，钻时进给速度为4-5m/min左右当钻孔接近完毕时。钻机行走到需要工作的位置后，将行走轮向后摆动180度，并操纵手柄使行走轮与方向轮离开地面，调整四只调节螺栓，使底座稳妥地置于工作位置上，此时底座平面离地。

使用钻孔取芯机前应仔细阅读机器的操作手册，不要进行无水作业。取芯完成后，要把适当部位擦净、晾干、涂油。待钻孔取芯机切削完毕，可保持旋转，提升钻头，距试件表面约有5mm时，可关闭电源，钻头离开试件表面，关闭水源，卸去固定螺栓，拖离取芯机，用夹钳取出试样。
钻孔取芯机安装上合适直径的空心钻头，将钻孔移至所需工作处，用膨胀螺丝将钻孔固定，调整地脚螺丝，使钻机稳定。如果机器在工作时汽油机冒烟，可能是机油过多，1需要抽出部分机油，机油进入燃烧室、卸下火花塞，然后拉动起动手柄，把机油完全排出。大钻孔取芯直径可以达到200毫米，大钻孔取芯深度700毫米。